Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slc1a1P51906 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a1P51906 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a1P51906 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a1P51906 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a1P51906 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a1P51906 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a1P51906 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a1P51906 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc1a1P51906 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms