Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod1P49813 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Tmod1P49813 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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Tmod1P49813 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmod1P49813 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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