Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtpreP49446 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtpreP49446 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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PtpreP49446 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtpreP49446 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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