Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tnni3P48787 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tnni3P48787 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms