Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Epb41P48193 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Epb41P48193 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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