Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gli1P47806 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms