Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf4P43488 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf4P43488 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms