Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PtgfrP43117 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms