Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf1P39428 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Traf1P39428 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms