Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Grin2aP35436 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Grin2aP35436 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms