Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mmp13P33435 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms