Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Saa4P31532 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Saa4P31532 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Saa4P31532 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Saa4P31532 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Saa4P31532 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms