Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa10P31310 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa10P31310 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa10P31310 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa10P31310 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa10P31310 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxa10P31310 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hoxa10P31310 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms