Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hoxc10P31257 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hoxc10P31257 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms