Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cd28P31041 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cd28P31041 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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