Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdk4P30285 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdk4P30285 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms