Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msr1P30204 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms