Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RxraP28700 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RxraP28700 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RxraP28700 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RxraP28700 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RxraP28700 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms