Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxd10P28359 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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