Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Apex1P28352 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Apex1P28352 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apex1P28352 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apex1P28352 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms