Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LoxP28301 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LoxP28301 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms