Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gjb1P28230 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb1P28230 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms