Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2afxP27661 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms