Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
U2af2P26369 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U2af2P26369 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms