Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmo2P25801 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lmo2P25801 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms