Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HdcP23738 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HdcP23738 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HdcP23738 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HdcP23738 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HdcP23738 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HdcP23738 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HdcP23738 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HdcP23738 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HdcP23738 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HdcP23738 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HdcP23738 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HdcP23738 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HdcP23738 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HdcP23738 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms