Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tsta3P23591 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tsta3P23591 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms