Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxd8P23463 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hoxd8P23463 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxd8P23463 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms