Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clk1P22518 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clk1P22518 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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