Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tap1P21958 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tap1P21958 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms