Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc2P20801 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms