Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NelfeP19426 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NelfeP19426 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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