Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rps6ka1P18653 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka1P18653 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms