Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tgfb3P17125 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms