Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SrgnP13609 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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SrgnP13609 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SrgnP13609 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SrgnP13609 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrgnP13609 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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SrgnP13609 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrgnP13609 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms