Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2P13373 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms