Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Schip1P0DPB4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms