Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Tmem254aP0DN89 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms