Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

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Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PtprqP0C5E4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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PtprqP0C5E4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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PtprqP0C5E4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprqP0C5E4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PtprqP0C5E4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms