Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprcP06800 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprcP06800 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprcP06800 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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PtprcP06800 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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PtprcP06800 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprcP06800 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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PtprcP06800 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprcP06800 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprcP06800 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtprcP06800 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PtprcP06800 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprcP06800 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtprcP06800 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprcP06800 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtprcP06800 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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PtprcP06800 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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PtprcP06800 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PtprcP06800 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtprcP06800 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms