Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifnb1P01575 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms