Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1AO95602 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1AO95602 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms