Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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