Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BlmO88700 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BlmO88700 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BlmO88700 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BlmO88700 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BlmO88700 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BlmO88700 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BlmO88700 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BlmO88700 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BlmO88700 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BlmO88700 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BlmO88700 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BlmO88700 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BlmO88700 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BlmO88700 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BlmO88700 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BlmO88700 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BlmO88700 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BlmO88700 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BlmO88700 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BlmO88700 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BlmO88700 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BlmO88700 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms