Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AurkcO88445 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AurkcO88445 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AurkcO88445 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms