Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nme6O88425 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms