Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gfi1bO70237 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gfi1bO70237 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gfi1bO70237 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gfi1bO70237 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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