Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itgb3O54890 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itgb3O54890 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms