Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CaluO35887 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CaluO35887 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CaluO35887 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CaluO35887 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CaluO35887 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CaluO35887 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CaluO35887 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CaluO35887 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms