Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd2O35245 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd2O35245 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms